Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC4Q8WW27 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms