Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms