Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r200Q8R281 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r200Q8R281 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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