Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms