Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx8Q8CFD4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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