Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC12

Cdan1, Codanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdan1Q8CC12 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdan1Q8CC12 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdan1Q8CC12 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdan1Q8CC12 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms