Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp20Q8C6M1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp20Q8C6M1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp20Q8C6M1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Usp20Q8C6M1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp20Q8C6M1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp20Q8C6M1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Usp20Q8C6M1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp20Q8C6M1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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Usp20Q8C6M1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp20Q8C6M1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp20Q8C6M1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp20Q8C6M1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp20Q8C6M1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp20Q8C6M1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp20Q8C6M1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp20Q8C6M1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Usp20Q8C6M1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Usp20Q8C6M1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Usp20Q8C6M1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp20Q8C6M1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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