Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms