Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP54Q7Z3B4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms