Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC8DQ7L1W4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms