Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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ScocQ78YZ6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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ScocQ78YZ6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms