Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NinlQ6ZQ12 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NinlQ6ZQ12 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms