Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smpd4Q6ZPR5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms