Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP26C1Q6V0L0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms