Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab35Q6PHN9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab35Q6PHN9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms