Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc3bQ6PDC0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc3bQ6PDC0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms