Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC8EQ6NSJ5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms