Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prg2Q61878 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg2Q61878 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms