Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brsk1Q5RJI5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brsk1Q5RJI5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms