Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf2Q5NC05 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf2Q5NC05 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms