Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f8Q58FA4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f8Q58FA4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms