Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk4Q3V129 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms