Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca4bQ3UW98 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca4bQ3UW98 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms