Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem253Q3UNB8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tmem253Q3UNB8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tmem253Q3UNB8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem253Q3UNB8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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