Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp4cQ3TKR3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nlrp4cQ3TKR3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4cQ3TKR3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4cQ3TKR3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4cQ3TKR3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms