Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TCOF1Q13428 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TCOF1Q13428 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms