Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STX4Q12846 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STX4Q12846 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
STX4Q12846 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
STX4Q12846 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STX4Q12846 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
STX4Q12846 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STX4Q12846 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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