Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Fmn1Q05860 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fmn1Q05860 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Fmn1Q05860 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms