Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smad1P70340 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad1P70340 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad1P70340 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad1P70340 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms