Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Chrna7P49582 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms