Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax7P47239 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax7P47239 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax7P47239 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax7P47239 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax7P47239 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms