Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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