Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd9P28357 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd9P28357 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd9P28357 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms