Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZfaP23607 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZfaP23607 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZfaP23607 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZfaP23607 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms