Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms