Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM1P11229 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms