Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm2P0DP27 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calm2P0DP27 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms