Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb2P0C1T1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb2P0C1T1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms