Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtaP09225 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtaP09225 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LtaP09225 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LtaP09225 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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LtaP09225 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtaP09225 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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LtaP09225 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtaP09225 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtaP09225 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtaP09225 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtaP09225 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms