Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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H3f3cP02301 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3cP02301 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3cP02301 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3cP02301 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3cP02301 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3f3cP02301 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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H3f3cP02301 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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H3f3cP02301 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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H3f3cP02301 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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H3f3cP02301 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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H3f3cP02301 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3f3cP02301 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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H3f3cP02301 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3cP02301 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3f3cP02301 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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H3f3cP02301 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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H3f3cP02301 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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H3f3cP02301 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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H3f3cP02301 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3cP02301 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3cP02301 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3cP02301 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3cP02301 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3cP02301 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3cP02301 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3f3cP02301 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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H3f3cP02301 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms