Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna2P01573 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna2P01573 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms