Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF4AO95239 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms