Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chrna4O70174 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Chrna4O70174 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chrna4O70174 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chrna4O70174 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chrna4O70174 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chrna4O70174 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chrna4O70174 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chrna4O70174 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chrna4O70174 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chrna4O70174 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms