Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfra3O35118 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra3O35118 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra3O35118 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra3O35118 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra3O35118 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra3O35118 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra3O35118 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra3O35118 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms