Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21310J3QQ23 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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