Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms