Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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