Protein–RNA interactions for Protein: J3QN86

Gm21882, Predicted gene, 21882, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21882J3QN86 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21882J3QN86 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21882J3QN86 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms