Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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