Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5218F6YH22 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms